L’université de Kabale est située sur la parcelle 364 Block 3 Kikungiri Hill, dans la municipalité de Kabale, à environ un kilomètre de l’autoroute Kabale-Katuna-Kigali.
L’université a été initialement créée en tant qu’institution communautaire à but non lucratif, appartenant à la population du Kigezi. L’université a ouvert ses portes en 2002 à quarante-deux (42) étudiants et compte aujourd’hui environ 3 500 inscrits venant de toutes les régions de l’Ouganda et des pays voisins du Kenya, de la Tanzanie, du Rwanda, du Burundi, du Congo (RDC) et du Sud-Soudan.